All'interno del Sistema Indicatori Ambientali è stata sviluppata una sezione dedicata esclusivamente all'interrogazione delle banche dati di carattere naturalistico. In particolare è stata posta una certa attenzione riguardo la biodiversità.

I paragrafi successivi descriveranno come:

• selezionare una porzione di territorio
• visualizzare la carta degli habitat
• ottenere informazioni su un poligono di interesse
• visualizzare le carte di valutazione
• sovrapporre più strati informativi
• interrogare il database di Rete Natura 2000